計畫類別 原主辦單位 計畫名稱 統籌計劃主持人
農業領域科技發展方案中程網要計畫                  
一、重點產業及資源保育利用研究發展
(二)發展農產品品質安全檢測技術,建立消費者信心
2.加強農藥毒理、製劑、檢測及施用技術研究
單一計畫 竹北分所 (1)常用藥物在魚蝦貝體內蓄積、釋放研究 彭弘光
漁業領域科技發展方案中程網要計畫                  
一、重點產業及資源保育利用研究發展
(一)開發優良品種及生產技術,提升農產品品質
2.建立動植物優良健康種畜禽及種苗繁殖體系
統籌計畫 竹北分所 (1)淡水魚介類之繁養殖及其生理生態研究 彭弘光
細部計畫 竹北分所 淡水魚介類之繁養殖及其生理生態之研究 彭弘光
細部計畫 鹿港分所 鰻魚人工繁殖研究 賴仲義
細部計畫 水產養殖系 東非產海水吳郭魚與淡水吳郭魚雜交育種試驗 劉文御
統籌計畫 台南分所 (2)海水魚蝦類之繁養殖及其生理生態研究 丁雲源
細部計畫 台南分所 新經濟海水魚類之開發技術研究-海水鯛類雜交之研究 丁雲源
細部計畫 台南分所 海水魚種苗生產技術之研究--(IV) 石斑魚類仔稚苗育成之探討 丁雲源
細部計畫 東港分所 魚類種苗生產技術開發改進研究 陳紫英
細部計畫 澎湖水族館 海水觀賞生物之繁、養殖試驗 蔡萬生
細部計畫 東港分所 優良種蝦和種苗之培育及其生殖調控研究 陳紫英
細部計畫 台南分所 環境壓迫對養殖魚類生殖影響及應用 丁雲源
細部計畫 台東分所 東部水產養殖開發研究  陳文義
細部計畫 水產試驗所 鰻魚種苗生產技術之基礎研究 廖一久
細部計畫 澎湖分所 澎湖地區海水魚類人工繁殖研究 林金榮
單一計畫 台西分所 (3)創新貝類繁養殖模式 劉富光
統籌計畫 台南分所 (4)魚蝦類養殖環境改善與疾病防治研究 丁雲源
細部計畫 台南分所 利用有機活菌液在田間草蝦養殖池之研究 丁雲源
細部計畫 台南分所 有益微生物在草蝦養殖應用及病害防治之效果 丁雲源
細部計畫 台南分所 飼料添加物及營養物質對魚蝦成長活存之研究 丁雲源
細部計畫 東港分所 水產生物病理、藥理研究與疾病防治 陳紫英
細部計畫 水產養殖系 建立海水蝦循環水立體養殖技術之研究 劉文御
4.發展海面箱網養殖管理技術
統籌計畫 東港分所 (1)箱網養殖魚類繁養殖及栽培漁業技術之研發 陳紫英
細部計畫 東港分所 箱網養殖魚類繁養殖及人工飼料開發研究 陳紫英
細部計畫 東港分所 台灣重要經濟魚介類栽培漁業技術之研發及其效益評估 陳紫英
單一計畫 澎湖分所 (2)海鱺分段式養殖相關技術之研發-澎湖地區 蔡萬生
單一計畫 東港分所 (3)海鱺分段式養殖相關技術之研發-小琉球地區 陳紫英
(二)發展農產品品質安全檢測技術,建立消費者信心
5.加強漁業資源合理利用及相關設施之研究
單一計畫 海洋漁業系 (1)水產試驗所試驗船運用計畫 廖學耕
統籌計畫 海洋漁業系 (2)台灣沿近海漁業資源之監測與管理之研究 廖學耕
細部計畫 高雄分所 台灣沿近海漁業資源之監測與管理之研究 蘇偉成
細部計畫 高雄分所 台灣海域鯔魚資源調查與監測 蘇偉成
細部計畫 海洋漁業系 台灣沿近海燈火漁業技術及魚類群聚之研究 秦韶生
細部計畫 漁業生物系 台灣沿近海拖網漁業資源之監測與管理之研究(東北沿近海) 陳春暉
細部計畫 漁業生物系 臺灣近海鮪類資源研究 陳春暉
細部計畫 漁業生物系 台灣週邊海域仔稚魚調查研究 陳春暉
細部計畫 高雄分所 台灣西南海域正櫻蝦生態及資源管理之研究 蘇偉成
細部計畫 漁業生物系 台灣近海頭足類資源研究 陳春暉
細部計畫 海洋漁業系 台灣沿岸人工魚礁漁場研究 王敏昌
細部計畫 台東分所 台灣東部海域漁業資源及漁場調查 陳文義
細部計畫 澎湖分所 澎湖人工魚礁與天然礁漁業生物之異同 蔡萬生
細部計畫 研考室 臺灣近海鯛及雜魚延繩釣漁獲性能調查 劉燈城
單一計畫 高雄分所 (3)沿近海漁場造成之研究 蘇偉成
單一計畫 海洋漁業系 (4)西北太平洋中深層漁業資源之調查與開發試驗研究 廖學耕
四、遙測技術研究發展
(一)發展精準農業,提昇農田經營管理效率
2.應用遙測技術於自然資源及國土經營管理
單一計畫 水產資訊系 (1)遙測技術之研發及其在海洋漁場與養殖環境上之應用 陳世欽
共通性領域科技發展方案中程網要計畫                  
一、重點產業及資源保育利用研究發展
(十)強化農業資訊體系,普及農業資訊的應用
1.強化農業資訊體系的研究發展
單一計畫 水產資訊系 (1)水產資訊的整合與應用 陳世欽
2.開發農業網際網路的相關應用
單一計畫 水產資訊系 (1)水產資訊網際網路應用技術之研發 陳世欽
生物技術領域科技發展方案中程網要計畫                  
(三)加強生物多樣性及遺傳資源保育利用研究
二、積極開發生物技術
(一)開發生物技術,發展高科技農業
1.研究關鍵生物技術與開發高價值產品
統籌計畫 鹿港分所 (1)水產養殖生物遺傳資源蒐集、保存、評估及利用 賴仲義
細部計畫 鹿港分所 水產養殖生物遺傳資源蒐集、保存、評估及利用 賴仲義
細部計畫 鹿港分所 建立魚類優良種原及保存體系 賴仲義
單一計畫 水產養殖系 (2)重要經濟性貝類染色體操作及其自動化 趙乃賢
統籌計畫 台南分所 (3)水產養殖生物技術開發與研究 丁雲源
細部計畫 台南分所 水產養殖生物生產技術開發與研究—維生素及石斑魚免疫力之相關探討 丁雲源
細部計畫 水產養殖系 優良抗菌基因之篩選及轉殖研究 劉文御
細部計畫 台南分所 蝦類生殖力研究 林明男
細部計畫 台南分所 養殖生物技術開發與改進 丁雲源
自動化領域科技發展方案中程綱要                                 
五、農漁牧產業自動化
(一)加強農業機械、自動化與電子化研究,提高產製儲銷效率
1.加強農業生產與管理自動控制技術之研發
統籌計畫 東港分所 (1)養殖漁業生產與管理自動化研究 陳紫英
細部計畫 東港分所 養殖漁業生產與管理自動化 陳紫英
細部計畫 台南分所 室內箱網養殖的基礎研究 林明男
細部計畫 水產養殖系 循環流水式自動化養蝦研究 劉文御
單一計畫 水產養殖系 (2)自動化超集約循環水養蝦系統之研發 劉文御
食品領域科技發展方案中程網要計畫                      
三、提升食品加工技術
(一)發展多樣化食品,滿足國人消費需求
3.開發保健食品
統籌計畫 水產加工系 (1)保健水產品之開發(水試所部分) 陳聰松
細部計畫 水產加工系 保健水產品之開發–Ⅰ.鰻生理活性物質評估 陳聰松
細部計畫 水產加工系 省產大宗水產品藥膳產品開發 陳聰松
4.開發國產大宗農產品加工技術 
統籌計畫 水產加工系 (1)養殖魚類之魚肉品質及加工利用 陳聰松
細部計畫 水產加工系 養殖鰻魚品質及其非破壞性分析方法之研究 陳聰松
細部計畫 澎湖分所 海水箱網養殖魚類之魚肉品質及加工利用 蔡萬生
統籌計畫 水產加工系 (2)省產大宗漁獲物休閒性食品之開發 陳聰松
細部計畫 水產加工系 鯖魚調味乾製品之製造 陳聰松
細部計畫 高雄分所 低溫調理燻製品 蘇偉成
環保領域科技發展方案中程網要計畫                  
一、重點產業及資源保育利用研究發展
(五)加強農業廢棄物利用及公害防治研究,改良生產環境
3.加強農業公害防治調查及研究
統籌計畫 台南分所 (1)養殖環境、用水水質調查及應用試驗 林世榮
細部計畫 台南分所 養殖環境、用水水質調查及應用試驗 林世榮
細部計畫 東港分所 重金屬與水生生物之關係 陳紫英